【服务介绍】DNA甲基化是衰老过程中的重要表观遗传改变之一。随着个体衰老的加剧,特定的甲基化位点(CpG)显示出与年龄相关的动态变化。利用机器学习分析这些随年龄变化的CpG位点,可以构建一个用于预测甲基化年龄的数学模型,这一过程被称为表观遗传时钟。该时钟能够量化生物体衰老速度,并评估长寿和抗衰老干预措施的效果。
在此背景下,尊龙凯时对100只小鼠的血液基因组DNA进行了初步检测,分析了数百个与衰老相关的甲基化位点。这些数据构建了一个包含多种生物样本以及多衰老相关甲基化位点随小鼠月龄变化的甲基化频率数据库。通过机器学习,该团队从中筛选出与小鼠月龄有显著变化且相关性较强的甲基化位点,进而打造出甲基化年龄预测器。
使用该预测器,研究人员对经历生殖压力的雌性小鼠的甲基化年龄进行了预测,验证了这一模型的可行性。
【合作方式】技术服务
【检测对象】物种样本类型:
- CpG位点
- 小鼠血液
- 雌性/4个,雄性/3个
【技术方案】目标区间:结合亚硫酸盐转化的甲基化重测序(Hi-Methylseq)及靶向扩增子高通量测序技术,能够实现多个区域与多个位点的甲基化精确定量分析。
【服务流程】详细的检测过程将保证结果的准确性和可靠性。
【检测结果展示】
- 选定甲基化位点随小鼠月龄变化的显著性
- 预测生殖压力雌性小鼠的甲基化年龄:
- CpG1、CpG2、CpG3、CpG4的甲基化年龄预测模型
- 甲基化年龄(月龄)与加速效应(月龄):
- 衰老加速组:甲基化水平(实际年龄18月龄)为440596727305
- 自然衰老组:甲基化水平(实际年龄18月龄)为373525823669172221681824
备注:甲基化预测模型为多元一次方程式,检测小鼠样本的甲基化年龄时,只需将选定甲基化位点的甲基化水平带入模型,即可求得生物样本的甲基化年龄。通过该模型,预测自然衰老组小鼠(实际年龄18月龄)的甲基化年龄为1824月龄,而经历多次生殖压力的雌性小鼠的甲基化年龄则为222月龄,显示衰老加速效果为396个月。
参考文献: [1] Rivero-Segura NA, Bello-Chavolla OY, Barrera-Vázquez OS, et al. Promising biomarkers of human aging: In search of a multi-omics panel to understand the aging process from a multidimensional perspective. Ageing research reviews, 2020, 64:101164 [2] Petkovich DA, Podolskiy DI, Lobanov AV, et al. Using DNA methylation profiling to evaluate biological age and longevity interventions. Cell metabolism, 2017, 25(4):954-960e6 [3] Stubbs TM, Bonder MJ, Stark AK, et al. Multi-tissue DNA methylation age predictor in mouse. Genome biology, 2017, 18:1-14 [4] Wang Y, Karlsson R, Lampa E, et al. Epigenetic influences on aging: a longitudinal genome-wide methylation study in old Swedish twins. Epigenetics, 2018, 13(9):975-987